Прилепите в Деветашката пещера са значително по-малко, а шумът е недопустимо голям. Това стана ясно след проверка на РИОСВ – Плевен и експерти от Центъра за изследване и защита на прилепите (ЦИЗП) към Националния природонаучен музей. Тя беше направена след сигнали от природозащитници, че при снимките на филма "Непобедимите 2" в Деветашката пещера се вреди на околната среда.   Резултатите от проверката потвърждават негативното влияние върху прилепите от строежа на декорите на филма каквито бяха и опасенията за природозащитниците. В пещерата се изграждат декори и конструкции за целите на продукцията. Част от тях достигат тъмната част, въпреки че затова е била поставена изрична забрана от страна на РИОСВ. В пещерата има постоянно движение на превозни средства.  Всичко това генерира изключително високи нива на шум, допълнително усилени от естествената акустика на пещерата.   

Това води до постоянно безпокойство на прилепните колонии, поради което прилепите се намират в полуактивно състояние, а не в зимен сън. В следствие на това те изразходват значително повече енергия и преждевременно намаляват хранителните си запаси, чрез които трябва да преживеят до края на зимата.    Звуковото замърсяване и периодичното присъствие на работници в полутъмните и тъмни части на основната галерия е причина за изместването на прилепите към вътрешните части на пещерата, които не са подходящи за зимуване поради по-високата температура в тези галерии.     В пещерата са били установени зимуващи прилепни колонии, но по оценка на експертите, прилепите са забележимо по-малочислени в сравнение с предишни години. Така например, през зимата на 2010-2011 г. числеността на колонията е била около 35 000 индивида. В момента прилепите в пещерата наброяват едва около 8 600 екземпляра.   В пещерата не са били установени загинали прилепи, което се дължи на факта, че подземната река отнася по течението си всичко извън пещерата. Това, както и наличието на множество ракообразни в реката, хранещи се с мъртвите прилепи, не позволяват да се констатира дали и каква е смъртността сред прилепите в следствие на безпокойството. Допълнително за това допринася и фактът, че не е била направена оценка от експерти преди започването на дейностите в пещерата, което щеше да позволи по-пълна оценка на ситуацията.